Новая религия утвердилась преимущественно у равнинных народов Лусона и Бисайских островов. Народы внутренних горных областей, формально находившиеся под властью Испании, не были затронуты христианизацией и испанским культурным влиянием. Внедрение христианства сплачивало между собой одни народы и отдаляло от них другие, родственные им.

Таково, очевидно, соотношение между принявшими христианство пангасинанами и горным народом ибалои. Различные группы илонготов образовались в результате миграций сопротивлявшихся крещению жителей долин, поднявшихся по реке Пампанга в горы, где в дальнейшем они смешались в той или иной степени с негритосами.

Испанские колонизаторы на Филиппинах, в отличие от своих американских колоний, сохранили некоторые местные социально-экономические институты, модифицировав их и приспособив к собственным нуждам. Так, после ликвидации режима энкомендеро была восстановлена система барангаев, превращенных испанцами в основные административно-налоговые единицы. В процессе колонизации Филиппин испанцы ассимилировали местную знать, превратив ее в привилегированную бюрократическую прослойку, представители которой занимали низшие посты в колониальной администрации.

Испанским языком владела лишь эта небольшая прослойка местного населения. Простым филиппинцам запрещалось изучать язык колонизаторов. Это ослабило восприятие элементов испанской культуры народами Филиппин. В XIX в. на Филиппинах появилась пресса и стала развиваться литература на испанском языке. Однако она была доступна опять-таки лишь образованной части филиппинского общества.

На протяжении всего периода испанского господства метисация с испанцами происходила в крайне незначительных масштабах. Это объяснялось малочисленностью испанцев в колонии из-за ее удаленности от метрополии, экономической изоляции, незаинтересованности короны в эффективной эксплуатации Филиппин. Известную роль в формировании этнического и культурного облика народов Филиппин сыграл китайский элемент. Торговые контакты с Китаем сохранились и после завоевания островов Испанией.