Особое положение занимают так называемые негрито—аэта и баттаки. Обычно считается, что критерием их выделения служит расовая принадлежность к негроидному типу австралоидной расы, однако, с одной стороны, в результате смешений среди аэта и баттаков можно встретить немало явно монголоидных типов, а с другой, негроидный элемент настолько активно участвовал в сложении многих других народов Филиппин, особенно горных, что некоторые из них не всегда внешне легко отличимы от негрито.

Основное отличие этой группы лежит опять-таки в области культуры. До недавнего времени они имели хозяйство, основанное по преимуществу на охоте и собирательстве, и соответствующую этой основе духовную и материальную культуру. В настоящее время, с переходом большинства негрито на оседлость и земледелие, эта этническая группа находится в процессе интенсивного размывания.

К национальным меньшинствам, наконец, следует отнести и небольшой контингент неаборигенного населения — выходцев из других, в основном азиатских, стран.

Этническая картина Филиппин до появления там малайе-полинезийцев не может быть определена с достаточной полнотой. Существует предположение, что древнейшее население архипелага принадлежало к различным вариантам негро-австралоидной большой расы. Потомками этого населения являются, вероятно, аэта. Во II тыс. до н. э. началось заселение островов малайе-полинезийцами.

Не исключено, что в это же время на Филиппины проникли и мон-кхмеры, впоследствии растворившиеся среди местного населения. Малайе-нолинезийцы предопределили этническую картину архипелага, который вплоть до испанского завоевания не представлял собой самостоятельного историко-этнографического региона, а скорее входил в состав большой индонезийской области.